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電気通信大学 
大学院情報理工学研究科、情報理工学域 
情報・ネットワーク工学専攻、Ⅰ類 (情報系) 

助教 
関 新之助 
セキ シンノスケ 
Shinnosuke SEKI 

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経歴
University of Western Ontario  Department of Computer Science  Postdoctoral Researcher  2010/09/01-2011/04/30 
京都大学  薬学研究科  博士研究員  2011/05/01-2012/02/15 
Aalto University  Department of Information and Computer Science  Postdoctoral Researcher  2012/02/16-2013/08/31 
Academy of Finland  Postdoctoral Researcher, Principal Investigator  2013/09/01-2015/03/31 
Ecole Normale Superieure de Lyon  Invited Professor  2018/09/01-現在 

学歴
電気通信大学  情報工学専攻  博士前期  2006/03/31  卒業 
ウェスタンオンタリオ大学  Department of Computer Science  博士  2010/08/31  卒業 

学位
博士(理学)  University of Western Ontario  2010/10/29 

学内担当授業科目
2018  情報領域演習第二  前期  学部(昼間) 
2018  情報領域演習第一  後期  学部(昼間) 
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学外担当授業科目
2014  組合せ論  アールト大学 
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現在の専門分野
情報学基礎理論 
ナノマイクロシステム 
計算科学 

研究キーワード
自己組織化理論 

現在の研究課題
DNAパターン自己組織化システムの最適化  2012/09/01-現在 

著書
著書  Proceedings of the 18th International Conference on Unconventional Computation and Natural Computation  Springer  2019 
著書  Proceedings of the 22nd International Conference on Developments in Language Theory (DLT2018, Tokyo, Japan, September 10-14, 2018)  Springer  2018/08/06 
著書(辞書・辞典)  Encyclopedia of Algorithms  Shinnosuke Seki  Springer  2016 
著書  自然計算についてのハンドブック  Lila Kari, Shinnosuke Seki, Petr Sosik  Springer  1073-1127  2012 
著書  言語理論の進展に関する第14回国際会議紀要  Yuan Gao, Hanlin Lu, Shinnosuke Seki, Sheng Yu  Springer  2010 
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論文
一般論文  有  Oritatami: a computational model for molecular co-transcriptional folding  共著  Cody Geary, Pierre-Etienne Meunier, Nicolas Schabanel, Shinnosuke Seki  International Journal of Molecular Sciences  Not assigned yet  2019 
一般論文  有  Self-attraction removal from oritatami systems  共著  Yo-Sub Han, Hwee Kim, Trent A. Rogers, and Shinnosuke Seki  International Journal of Foundations of Computer Science  Not assigned yet  2019 
一般論文  有  Nondeterministic seedless oritatami systems and hardness of testing their equivalence  共著  Yo-Sub Han, Hwee Kim, Makoto Ota, Shinnosuke Seki  Natural Computing  17/ 1, 67-79  2018 
一般論文  有  The complexity of fixed-height patterned tile self-assembly  共著  Shinnosuke Seki, Andrew Winslow  International Journal of Foundations of Computer Science  28/ 5, 465-482  2017 
一般論文  有  Oritatami system: a survey and the impossibility of simple simulation at small delays  共著  Trent A. Rogers, Shinnosuke Seki  Fundamenta Informaticae  154, Not assigned yet-  2017 
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研究発表
学会口頭発表  On the power of oritatami cotranscriptional folding with unary bead sequence  15th Annual Conference on Theory and Applications of Models of Computation  LNCS 11436  有  Kohei Maruyama, Reoto Morita  2019/04/13 
学会口頭発表  Transcript desing problem of oritatami systems  24th International Conference on DNA Computing and Molecular Programming  LNCS 11145  有  Hwee Kim  2018/10/08 
学会口頭発表  Know when to fold 'em: Self-assembly of shapes by folding in oritatami  24th International Conference on DNA Computing and Molecular Programming  LNCS 11145  有  Nicolas Schabanel  2018/10/08 
学会口頭発表  Towards the algorithmic molecular self-assembly of fractals by cotranscriptional folding  23rd International Conference on Implementation and Application of Automata (CIAA 2018)  LNCS 10977  有  Yusei Masuda and Yuki Ubukata  2018/07/30 
学会口頭発表  Cotranscriptional Folding: A Frontier in Molecular Engineering  京都大学数理解析研究所RIMS共同研究(公開型)「代数系、論理、言語とその周辺領域」  N/A  無  Shinnosuke Seki  2018/02/20 
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受賞
LA/EATCS Best Presentation Award  2018/02/07 
CIAA 2016 Best Paper Award (Sheng Yu Award)  2016/07/21 
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研究員受入れ
国内  客員研究員  Finland  Aalto University  派遣元  2017-2017 
国外  客員研究員  Republic of Korea  Yonsei University  派遣元  2015-現在 
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科学研究費助成事業
万能折り畳みシステムの小型化とその限界  2018/06/29-2020/03/31 
共転写性フォールディングによる自己組織化システムの実際的設計と最適化  若手研究(A)  2016/04/01-2018/03/31 
共転写性フォールディングの数理モデル化とチューリング完全性  研究活動スタート支援  2015/04/01-2016/03/31 
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外部資金
国際会議UCNC2019への助成  その他助成金  立石科学技術振興財団  2018/09/25-2019/06/07 
国際会議DLT2018への助成  その他助成金  情報通信研究機構  Support for the 22nd International Conference on Developments in Language Theory (DLT 2018)  2018/04/01-現在 
国際会議DLT2018への助成  奨学寄附金  (株)久保田情報技研  国際会議DLT2018開催支援寄付金  2017-現在 
国際会議DLT2018への助成  その他助成金  電気通信普及財団  シンポジウム・セミナー 振興普及援助  2017/09/01-現在 
機関選抜のため、研究テーマはなし  その他助成金  科学技術振興機構  2015/08/06-2017/03/31 
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共同・受託研究実績
Self-assembly of computational mechanisms by cotranscriptional folding  2017-現在  共同研究  国際共同研究 
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会議・研究会等
46th International Conference on Current Trends in Theory and Practice of Computer Science (SOFSEM 2020)  Program Committee member  2020/01/20 
13th International Conference on Reachability Problems (RP 2019)  Program Committee member  2019/09/11 
24th International Conference on Implementation and Applications of Automata (CIAA 2019)  Program Committee member  2019/07/22 
18th International Conference on Unconventional Computation and Natural Computation (UCNC 2019)  Organizing Committee Chair  2019/06/03 
18th International Conference on Unconventional Computation and Natural Computation (UCNC 2019)  Program Committee Chair  2019/06/03 
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委員会・審議会等
New Generation Computing  Area Editor  2019/09/01-現在 
Springer Natural Computing Book-Series  Advisory Board  2018/04/26-現在 
情報処理学会アルゴリズム研究会  専門委員  2018/04/01-現在 
Steering Committee of International Conference on Developments in Language Theory (DLT)  関 新之助  2017/08/07-現在 
情報処理学会論文誌「数理モデル化と応用」編集委員会  関 新之助  2014/10/01-現在 
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マスコミ取材
新聞  日刊工業新聞  「分子機械、実験・理論研究進む‐1本のひもで計算可能に」というタイトルで、私が提唱したRNAの共転写性フォールディングによる計算の数理モデル「折り畳みシステム」が取り上げられた。  2015/08/11 
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